Organiser

Dessiner le plan de plaque avant de pipeter

Nommez vos groupes, fixez les réplicats, excluez les bords si besoin : l’outil place chaque échantillon sans collision, par blocs ou au hasard avec une graine reproductible. Échangez deux puits à la main, puis exportez le plan.

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L’outil : Plan de plaque 96 puits

Exemple de démonstration chargé : modifie les valeurs, le résultat se met à jour tout de suite.

Exemple chiffré

Plaque 96 puits (8 lignes × 12 colonnes), bords exclus : les 36 puits de bord sont retirés, il en reste 60. Six groupes de 6 réplicats (témoin non traité, trois conditions, contrôle positif, blanc de milieu) occupent 36 puits ; 24 restent libres.

CalculRésultat
Puits de bord : 2 × 12 + 2 × 636
Puits utilisables : 96 − 3660
Puits nécessaires : 6 groupes × 636
Puits libres : 60 − 3624

Avec la même graine et les mêmes réglages, le plan obtenu est toujours identique : notez la graine dans votre cahier de laboratoire.

Méthode, hypothèses et limites

  • Placement : les puits disponibles (hors exclusions) sont parcourus par lignes ou par colonnes, ou mélangés par un générateur pseudo-aléatoire à graine (mulberry32, algorithme de Fisher-Yates), puis remplis groupe après groupe.
  • Pourquoi randomiser : les bords s’évaporent et chauffent différemment, et un gradient de pipetage peut confondre une condition avec une position. Répartir les groupes au hasard et exclure les bords limite ces biais ; ce n’est pas une garantie.
  • Vérification : l’outil compte les puits par groupe et signale un manque de place ou un échantillon sur un puits exclu après vos échanges manuels.
  • Limites : organisation de plaque uniquement. Aucun protocole, aucune dilution ni aucun traitement n’est proposé ici. Adaptez le plan à votre méthode validée.

Pour aller plus loin : randomisation et effets de plaque, réplicats techniques ou biologiques.

Questions fréquentes

Faut-il vraiment exclure les puits de bord ?

Pas toujours. L’évaporation rend les bords plus sensibles sur les longues incubations ; beaucoup de laboratoires les remplissent de milieu ou de liquide et ne les utilisent pas. Suis ta méthode validée.

À quoi sert la graine ?

À retrouver exactement la même répartition aléatoire. Garde la graine avec le format et la liste des groupes dans ton cahier.

Puis-je déplacer un échantillon à la main ?

Oui : en mode « échanger », clique un premier puits puis un second. L’outil recompte et signale les anomalies.

Mes groupes sont-ils enregistrés ?

Non. Tout reste dans la page ; exporte le CSV ou le SVG pour conserver le plan.

Confidentialité : tout se passe dans ton navigateur. Les valeurs saisies ne sont ni envoyées, ni enregistrées, ni associées à un compte ; recharger la page les efface. Ces outils sont des aides de calcul et d’organisation pour le laboratoire in vitro : ils ne fournissent ni protocole d’usage, ni dose, ni conseil médical.